4500-4000 π.Χ.: Νεολιθική περίοδος. Πρώτες μαρτυρίες ανθρώπινης εγκατάστασης στην Αθήνα, στο χώρο του βράχου της Ακρόπολης. 

3000: Πρώτες μαρτυρίες για ανθρώπινη παρουσία στην Αγορά, βάσει κεραμικών ευρημάτων του τέλους της Νεολιθικής περιόδου σε πηγάδια. 

3000-2000: Πρώιμη εποχή του Χαλκού. Με εξαίρεση διάσπαρτα όστρακα αγγείων, δεν έχουν εντοπιστεί ίχνη ανθρώπινης παρουσίας στην Αγορά. 

2000-1600: Μέση εποχή του Χαλκού. Η Αθήνα της εποχής του Χαλκού προεκτείνεται στο χώρο της μετέπειτα Αγοράς. 

1600-1100: Ύστερη εποχή του Χαλκού. Στην Αγορά λειτουργούσε εκτεταμένο μυκηναϊκό νεκροταφείο. 

1100-900: Υπομυκηναϊκή-Πρωτογεωμετρική περίοδος. Η Αγορά συνεχίζει να χρησιμοποιείται ως χώρος ταφής και κατά τους Σκοτεινούς Αιώνες. 

900-700: Γεωμετρική Περίοδος. Άνοδος του πληθυσμού στην Αγορά, όπως μαρτυρείται από μεγάλο αριθμό ταφών και πηγαδιών. 

700-480: Αρχαϊκή περίοδος  

700-600: Σημαντικός περιορισμός των ταφών στην Αγορά, που θεωρείται ότι οφείλεται σε μείωση του πληθυσμού της πόλης λόγω ξηρασίας. 
632: Αποτυχία της απόπειρας επιβολής τυραννίας από τον Κύλωνα.
621: Νομοθεσία του Δράκοντα. 
594/593: Νομοθεσία του Σόλωνα. 
566: Αναδιοργάνωση της εορτής των Μεγάλων Παναθηναίων από τον άρχοντα Ιπποκλείδη. Οι αθλητικοί αγώνες διεξάγονται στην Αγορά. 
562/561: Ο Πεισίστρατος γίνεται τύραννος στην Αθήνα.
534/533: Ο Θέσπις παρουσιάζει τα πρώτα έργα του. 
527: Θάνατος του Πεισιστράτου. 
527-514: Τυραννία των γιων του Πεισιστράτου, Ιππία και Ιππάρχου. Την εποχή αυτή χτίζεται η Νοτιοανατολική Κρήνη και ο αρχικός Βωμός των 12 Θεών. 
514: Ο Ίππαρχος δολοφονείται από τον Αρμόδιο και τον Αριστογείτονα, μπροστά στο Λεωκόρειον, την ώρα που παρακολουθούσε την πομπή των Παναθηναίων. 
510: Η Αθήνα καταλαμβάνεται από τους Σπαρτιάτες και η τυραννία του Ιππία καταλύεται. 
508/507: Ο Κλεισθένης προωθεί το πρόγραμμα των μεταρρυθμίσεων του αθηναϊκού πολιτεύματος που οδηγεί στη Δημοκρατία.
506: Οι Αθηναίοι νικούν το συνασπισμό Ευβοέων, Βοιωτών και Πελοποννησίων. Ιδρύεται το Αιακείον. 
500 περίπου: Η αρχαϊκή Αγορά δεν είναι ακόμη το διοικητικό κέντρο της πόλης. Την εποχή αυτή οικοδομούνται το Παλαιό Βουλευτήριο, το Κτήριο F και η αρχική Βασίλειος Στοά.
500-499: Καταρρέουν τα ικρία, από τα οποία παρακολουθούσαν οι Αθηναίοι θεατρικές παραστάσεις στην Αγορά. 
 
480-323: Κλασική περίοδος 

480-479: Η Αθήνα καταλαμβάνεται από τους Πέρσες, οι οποίοι καταστρέφουν την Ακρόπολη και τα περισσότερα κτήρια της Αγοράς. 
479-478: Ανέγερση του Θεμιστόκλειου τείχους. 
478-477: Ίδρυση της Α΄ Αθηναϊκής Συμμαχίας.
472-460 περίπου: Εποχή της πολιτικής κυριαρχίας του Κίμωνα στην Αθήνα. Πρώτη προσπάθεια συνολικής διαμόρφωσης του χώρου της Αγοράς, με την κατασκευή δημόσιων (Θόλος, Ποικίλη Στοά) και θρησκευτικών κτηρίων (ναός του Ηφαίστου).
451-429: Η Αθήνα του Περικλή. Στο χώρο της Αγοράς χτίζονται σπουδαία οικοδομήματα, όπως η Στοά του Ελευθερίου Διός. 
450 περίπου: Μεταφέρονται οι μουσικοί και ραψωδικοί αγώνες των Παναθηναίων από την Αγορά στο χώρο του Ωδείου του Περικλή. 
431-404: Πελοποννησιακός πόλεμος. 
430-429: Λοιμός στην Αθήνα. Θάνατος του Περικλή. 
415: Ακρωτηριασμός των Ερμών και βεβήλωση των Ελευσίνιων Μυστηρίων. Οι Αθηναίοι συγκεντρώνονται ένοπλοι στο χώρο της Αγοράς φοβούμενοι πραξικόπημα. 
413: Ολιγαρχικό πραξικόπημα καταλύει τη Δημοκρατία.
411: Η Δημοκρατία επανέρχεται στην Αθήνα. Ανοικοδόμηση του Νέου Βουλευτηρίου. 
404: Κατάληψη της Αθήνας από τους Σπαρτιάτες. Πολίτευμα των 30 τυράννων. 
403: Έπειτα από μάχες, οι δημοκρατικοί καταλύουν το πολίτευμα των 30 τυράννων. 
399: Δίκη και θανάτωση του Σωκράτη. 
395-390: Κορινθιακός πόλεμος.
378/377: Ίδρυση της Β΄ Αθηναϊκής Συμμαχίας. 
357-355: Συμμαχικός πόλεμος.
Μέσα 4ου αι.: Οικοδομείται ο ναός του Διός Φρατρίου και της Αθηνάς Φρατρίας. 
338: Μετά την ήττα τους στη μάχη της Χαιρώνειας, οι Αθηναίοι δέχονται στην πόλη τους το Φίλιππο και τον Αλέξανδρο. 
336-324: Αρχή του ρήτορα Λυκούργου στην Αθήνα. Η πόλη λαμπρύνεται με νέα οικοδομήματα, ιδιαίτερα στο χώρο της Αγοράς (ναός του Απόλλωνος Πατρώου, Τετράπλευρο Περιστύλιο κλπ.). Τα αγωνίσματα των Παναθηναϊκών Αγώνων μεταφέρονται από το χώρο της Αγοράς στο χώρο του Σταδίου.
 
 
323-30 π.Χ.: Ελληνιστική περίοδος  

323/322: Λαμιακός πόλεμος. Οι Μακεδόνες του Αντιπάτρου καταλαμβάνουν την Αθήνα και καταλύουν τη Δημοκρατία.
317-307: Ο βασιλιάς της Μακεδονίας Κάσσανδρος τοποθετεί το Δημήτριο Φαληρέα διοικητή της Αθήνας. 
307: Ο Δημήτριος Πολιορκητής καταλαμβάνει την πόλη και εισέρχεται θριαμβευτής. Χτίζεται η μνημειακή πύλη με το μνημείο του Δημητρίου.
301-300: Ο Ζήνων από το Κίτιον ιδρύει τη Στωική Σχολή φιλοσοφίας στο χώρο της Ποικίλης Στοάς. 
300-299: Τυραννία του Λάχαρη
267-262: Χρεμωνίδειος πόλεμος.
262-229: Η Αθήνα υπό μακεδονικό έλεγχο.
197: Η Αθήνα πολεμά τους Μακεδόνες στο πλευρό των Ρωμαίων
180 περίπου: Δωρίζεται από το Φαρνάκη του Πόντου η Μέση Στοά. 
150 περίπου: Οικοδόμηση της Στοάς του Αττάλου, της Νότιας Στοάς και του Ανατολικού Κτηρίου. 
146: Η Αθήνα είναι ελεύθερο κράτος και σύμμαχος της Ρώμης. 
86: Κατά τη διάρκεια του Α΄ Μιθριδατικού πολέμου, ο Ρωμαίος στρατηγός Σύλλας πολιορκεί την Αθήνα, την καταλαμβάνει και προξενεί εκτεταμένες καταστροφές στα κτήρια της Αγοράς. 
58: Η Αθήνα γίνεται υποτελής της Ρώμης.
42: Η Αθήνα αποτελεί το προπύργιο του Μάρκου Αντωνίου στην Ελλάδα. 
 
30 π.Χ.-330 μ.Χ.: Ρωμαϊκή περίοδος 

30 π.Χ.-14 μ.Χ.: Εποχή του Αυγούστου. Στην Αγορά γίνονται εκτεταμένες εργασίες: μεταφορά του ναού του Άρεως, ανοικοδόμηση της Θόλου. 
50: Ο Απόστολος Παύλος επισκέπτεται στην Αθήνα. 
124-132: Ταξίδια του Αδριανού στην Αθήνα.
131: Ιδρύεται το Πανελλήνιον. 
Mέσα 2ου αι.: Η Αγορά, χάρη στις ευεργεσίες του Ηρώδου του Αττικού και άλλων πλούσιων Αθηναίων, λαμπρύνεται με μια σειρά σπουδαίων οικοδομημάτων (ανοικοδόμηση Ωδείου, Βιβλιοθήκη του Πανταίνου, Νοτιοανατολική Στοά).  150-175: Ο περιηγητής Παυσανίας επισκέπτεται και περιγράφει την Αγορά της Αθήνας. 
253-262: Χτίζεται το Βαλεριανό τείχος. 
267: Οι Έρουλοι επιδράμουν στην Αθήνα και καταστρέφουν τα περισσότερα κτήρια της Αγοράς, πλην αυτών της δυτικής πλευράς. Μεταξύ 267 και 282: Χτίζεται το νέο τείχος της πόλης που διασχίζει την Αγορά.
 
330-610: Πρώιμη Βυζαντινή περίοδος 

395: Επιδρομή του Αλαρίχου στην Αθήνα. Θεωρείται πιθανό ότι την εποχή εκείνη έγιναν οι εκτεταμένες καταστροφές στα κτήρια της δυτικής πλευράς, τα οποία είχαν διασωθεί από τους Ερούλους.
Τέλη 4ου-αρχές 5ου αι.: Έντονη φάση ανοικοδόμησης στο χώρο της Αγοράς, με πολυτελείς οικίες. Οι ναοί μετατρέπονται σε εκκλησίες. Οικοδόμηση του Γυμνασίου. 
Τέλη 4ου-αρχές 5ου αι.: Έντονη φάση ανοικοδόμησης στο χώρο της Αγοράς, με πολυτελείς οικίες. Οι ναοί μετατρέπονται σε εκκλησίες. Οικοδόμηση του Γυμνασίου. 
582-583: Σλαβική επιδρομή στη Νότια Ελλάδα. Καταστροφές στην Αγορά της Αθήνας. 
 
610-1204: Μέση Βυζαντινή περίοδος 

9ος αιώνας: Βυζαντινός οικισμός στο χώρο της Αγοράς.
1147: Επιδρομή Νορμανδών στην Αθήνα. 
β΄ μισό 12ου αι.: Επιδρομή Αράβων. Κατάληψη της πόλης. 
 
1204-1456: Φραγκοκρατία 

1204: Κατάληψη της Αθήνας από τους Φράγκους. 
1204-1311: Δουκάτο της Αθήνας.
1311-1388: Την Αθήνα διοικεί η Καταλανική Εταιρεία. 
1388-1446: Η Αθήνα στα χέρια των Ενετών και των Acciaiuoli. 
1434, 1446: Επίσκεψη του Κυριακού της Ανκόνας. 
 
1456-1821: Οθωμανική περίοδος 

1830: Ίδρυση του Ελληνικού κράτους. 

1859-1862: Εργασίες για την κατασκευή του ηλεκτρικού σιδηροδρόμου. Έρευνες της Εν Αθήναις Αρχαιολογικής Εταιρείας στο χώρο της Αγοράς: ανακάλυψη της Στοάς του Αττάλου.  

1895-1896: Γίνονται έρευνες στην Αγορά της Αθήνας από το Γερμανικό Αρχαιολογικό Ινστιτούτο στην Αθήνα, με επικεφαλής τον W. Dörpfeld. Αποκαλύπτεται ο ναός του Απόλλωνος Πατρώου.  

1907: Η εν Αθήναις Αρχαιολογική Εταιρεία διεξάγει περιορισμένες ανασκαφικές έρευνες στο χώρο της Αγοράς.  

1931: Η Αμερικανική Σχολή Κλασικών Σπουδών της Αθήνας ξεκινά το ανασκαφικό της έργο στην Αγορά της Αθήνας. Οι ανασκαφές συνεχίζονται μέχρι σήμερα, στο χώρο της Ποικίλης Στοάς και του ναού της Αφροδίτης Ουρανίας.  

1940-1945: Λόγω του πολέμου, σταματά η ανασκαφική δραστηριότητα στην Αγορά, ενώ τα ευρήματα αποθηκεύονται σε ειδικούς προφυλαγμένους χώρους.  

1956: Με βάση τα σχέδια του αρχιτέκτονα Ιωάννη Τραυλού, ανοικοδομείται σύμφωνα με την αρχική της μορφή η Στοά του Αττάλου, προκειμένου να χρησιμοποιηθεί για μουσείο των ευρημάτων της Αγοράς και για εργαστήρια και γραφεία της ανασκαφής.  

Δεκαετίες 1970 και 1980: Οι ανασκαφές επεκτείνονται στο βόρειο τμήμα της Αγοράς, πέρα από τον αρχαιολογικό χώρο. Αποκαλύπτεται η Ποικίλη Στοά.  

2004: Υπογράφεται στη Στοά του Αττάλου η συνθήκη προσχώρησης 10 νέων μελών στην Ευρωπαϊκή Ένωση.